干扰对微机保护装置的影响主要表现在以下几个方面。
2.1 计算或逻辑错误
微机保护装置的输入输出数据、微处理器计算的中间结果、控制标志字都存放在随机存贮器RAM中。在强电磁干扰信号作用下，有可能使存放在RAM中的数据发生变化。这样，在进行读或写数据时，数据总线和地址总线可能在干扰的作用下，发生读写错误数据，或将数据传送到错误的地址上，造成计算错误或逻辑紊乱，引起装置误动或拒动。
2.2 程序运行出轨
所谓程序只是微处理器可识别的机器码，在干扰信号的作用下，将可能出现微处理器无法识别的机器码，致使微处理器无法工作。此外，如果干扰信号改变了控制程序流向的标志字时，也将改变运行程序的执行顺序，使微机的运行程序出轨，出现死机等问题。
2.3 元件损坏
在微机保护装置中的一些半导体芯片，在强电磁干扰作用下，可能受到损坏，使装置无法工作。
3 电磁干扰的抑制措施
3.1 构造继电保护装置等电位面
基于微机的继电保护装置的重要特点：一是具有自检能力；二是具有通信功能。如果微机继电保护装置集中在主控制室，为了实现可靠通信，必须将联网的中央计算机和各套微机保护，以及其他基于微机的控制装置，都置于同一等电位平台上。这个等电位面应该与控制室地网，只有一点的，这样的等电位面的电位可以随地网的电位变化而浮动，同时也避免控制室地网的地电位差窜入等电位面，从而保持联网微机设备的地网之间无电位差，保证联网通信的可靠运行。
各微机设备都应有的、具有一定截面的接地线直接接到地等电位面上，设备上的各组件内外部的接地及零电位，都应由联线联到接地线上，接地线接到保护盘的接地端子，接地端子以适当截面的铜线接到接地网上，这样就形成了一个等电位面的地网。
构造等电位面有两种可能做法，一是将微机保护盘底部已有的接地铜排通过焊接联通，同时在尽头用100 mm2铜线联通，形成一个铜网格，这个网格与由电缆沟引来的粗铜导线联通。借该粗铜导线对控制室的接地点，形成要求的对地网的*一点接地。
另外一种做法，是在保护盘底部的下面构造一个的铜网格，各保护盘的接线端子，经一定截面铜线联到此一铜网格来实现。
3.2 高频同轴电缆屏蔽层两端分别接地
高频同轴电缆屏蔽层在开关场和控制室两端分别接地，可以显著地降低收发信机入口的干扰电压，保护收发信机的安全运行。若高频同轴电缆只在一端接地，在隔离开关操作空母线等情况下，必然在另一端产生暂态高电压，从而可能会在收发信机端子上产生高电压，中断收发信机的正常工作。
3.3 控制电缆屏蔽层在两端同时接地
当控制电缆为母线暂态电流产生的磁通所包围时，在电缆的屏蔽层中将感应出屏蔽电流，由屏蔽电流产生的磁通，将抵消母线暂态电流产生的磁通对电缆芯线的影响。假定屏蔽作用理想，两者共同作用的结果，将使被屏蔽层*包围的电缆芯线中的磁通为零，屏蔽层形成了一个理想的法拉第笼。这也和带有二次短路线圈的理想变压器一样，铁芯中的磁通将为零。
当雷电经避雷器注入地网，使变电所地网中的冲击电流增大时，将产生暂态的电位波动，同时地网的视在接地电阻也将暂时升高，与正常交流电阻相比，地电阻常常增大10倍以上。
当低压控制电缆在上述地电位升高的附近敷设时，电缆电位将随地电位的波动而受干扰。因此，接地浪涌电流引起的地电位升高，将可能对低压控制回路的绝缘配合带来严重影响。
继电保护装置抗干扰措施是一项十分重要的工作，深入开展保护装置抗干扰措施的研究，对电网安全稳定运行有着重要的现实意义。针对保护装置实际运行存在的电磁干扰问题，提出了相应的抑制措施，实践证明能有效提高变电所继电保护装置等二次设备的可靠性。